Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CCDC96Q2M329 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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