Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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