Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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