Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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