Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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