Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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