Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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