Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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