Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms