Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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