Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZMYND8Q9ULU4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms