Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms