Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms