Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms