Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms