Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6CQ9HCJ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms