Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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