Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms