Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPGRIP1Q96KN7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms