Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC11Q96J66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms