Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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