Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms