Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C10orf55Q5SWW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms