Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NDUFA9Q16795 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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