Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRADDQ15628 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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