Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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