Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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