Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL4A6Q14031 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms