Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms