Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASGEF1BQ0VAM2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms