Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN5Q08AF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms