Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms