Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms