Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAMQ00059 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAMQ00059 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms