Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms