Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms