Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB4P54760 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms