Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NESP48681 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NESP48681 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NESP48681 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NESP48681 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NESP48681 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NESP48681 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NESP48681 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NESP48681 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NESP48681 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NESP48681 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NESP48681 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NESP48681 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NESP48681 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms