Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms