Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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