Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FLT1P17948 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FLT1P17948 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FLT1P17948 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FLT1P17948 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FLT1P17948 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms