Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAV1P15498 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAV1P15498 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAV1P15498 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAV1P15498 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAV1P15498 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAV1P15498 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAV1P15498 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAV1P15498 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAV1P15498 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAV1P15498 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms