Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3APO60318 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms