Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXO3O43524 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXO3O43524 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms