Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BQV1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BQV1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BQV1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BQV1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BQV1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BQV1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQV1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQV1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms