Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DGG1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DGG1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DGG1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DGG1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DGG1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms