Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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