Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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