Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SAMD8Q96LT4 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms