Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FAM187BQ17R55 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms